広い館内の見学ルート（順序）は決められておらず、自由に見学することができます。

大きな水槽から、個体別の小さな水槽まで、1200種以上の生き物が鳥羽水族館で飼育されています。

飼育員さんの仕事である「３つのじ」⇒「調餌（ちょうじ）」、「給餌（きゅうじ）」、「掃除（そうじ）」の一つである潜水しながら水だこの水槽を掃除する様子も見学することができました。